En la segunda temporada, a medida que la lucha de la CIA contra el terrorismo se acerca más a casa, Joe, Kaitlyn y Byron reclutan a una nueva agente Lioness para infiltrarse en una amenaza desconocida hasta entonces. Con la presión aumentando desde todos los lados, Joe se ve obligado a enfrentarse a los profundos sacrificios personales que ha hecho como líder del programa Lioness.