¿Qué le sucedió al legendario instructor de la Academia de Ninjutsu? El año 2023 marcó el estreno de una nueva aventura en la que los jóvenes ninjas conocidos como "Nintama" se sumergen en un mundo de misterio y acción. A cargo del instructor Doi, la Academia de Ninjutsu es un lugar donde la disciplina y la habilidad se unen para crear verdaderos guerreros del siglo IX. Pero un día, Doi desaparece sin dejar rastro durante una misión para enfrentarse a un ninja del clan rival. Los Nintama se sienten inquietos por la seguridad de su instructor y deciden investigar para descubrir qué le sucedió. Mientras tanto, la Academia recibe noticias preocupantes de que sus rivales en el Castillo Dokutake podrían estar tramando algo. ¿Qué secreto esconden y qué papel desempeñarán los Nintama en la batalla inminente? Prepárate para una emocionante aventura llena de espionaje, acción y amistad.