Un mes después de los acontecimientos de la primera temporada, los espías de Citadel se encuentran en la clandestinidad y son perseguidos por agentes de Manticore por todo el mundo. Se ven obligados a salir de su escondite para unir fuerzas con un nuevo equipo de espías poco convencionales cuando el multimillonario brasileño de Manticore, Paulo Braga, amenaza con desatar en el mundo una tecnología catastrófica, creada por el propio Bernard Orlick, de Citadel.